Farmasimuseet består av faste utstillinger der besøkende kan se det komplette inventaret fra Apoteket Hjorten i Oslo fra 1861, et apotekerkontor, et systematisk offisin der gjenstander er plassert etter funksjon, et farmasøytgalleri med berømte farmasøyter, inventar fra Skillebekk fra 1960-tallet og laboratoriet fra Frogner apotek fra samme periode.

I annen etasje er det et innredet urteloft og et analyselaboratorium utstyrt slik det var på apotekene rundt 1914. Her er det også en legemiddelutstilling der legemidlenes historie knyttes opp mot de store folkesykdommene og medisinske gjennombrudd. 

I tillegg har vi skiftende temautstillinger i «hjørnerommet» i første etasje – for tiden utstillingen Min onkel triller piller om apotekenes legemiddelproduksjon gjennom tidene.